Закрытие месяц даёт ошибку "в организации на конец периода есть суммовые остатки по 90м и 91 счетам".
Посмотрел ОСВ по 91-му. В первую очередь временно удалил ручные операции. Но стало только хуже.
Куда копать дальше?

шёл декабрь, они закрывали август...

(0) Предыдущий месяц закрыт нормально, с восстановлением последовательности и без пропуска этапов?

(0) 1. Ручные операции в семействе ЕРП- зло. Нет, не так. РУЧНЫЕ ОПЕРАЦИИ - ЗЛО. Они могут быть использованы только там, где для учета не предусмотрены документы. Такие разделы учета есть, но они специфические и их мало.
2. Не надо активно лезть в старые периоды и менять расходы.
3. Ищите, что капнуло на 90 и 91 счет обходным путем. Проверяйте настройки ГФУ.
4. Иногда после правок задним числом лезут ошибки округления при решении СЛАУ. Грохните все распределения на финрезультат и перезакройте месяц.
(1) Ха, мы до сих пор правим некорректные вводы начальных остатков и перезакрываем с января. Правда это часто связано с желанием главбуха, чтобы все выглядело "красиво", без лишних документов.

(3) Я бы обобщил в целом - любой двойной(тройной, четверной и т.д.) учет - зло. Но к сожалению иногда приходится на это идти. Не все хотелки нашего государства и прочих хотельщиков можно удовлетворить одним сквозным учетом.

(0) оборотов по 91.09 нет - закрытия (минимум 91го счета) не было.
А вообще такую ошибку ловил в нескольких базах из-за битых итогов, пересчет помогал. Но тут ситуация другая, или ТС уже создал другую ситуацию.

(5) При выполнении операции "Формирование финансового результата" (которая должна закрывать 90 и 91) - закрывает "почти". На 91-м остаётся 1 копейка.
И даёт ошибку "в организации на конец периода есть суммовые остатки по 90м и 91 счетам".

(6) Можно попробовать эту копейку убрать операцией или сделать проверку не такой строгой.

(7) Опасаюсь, что потом эта копейка как неприкаянный дух будет где-нибудь вылазить.

(8) Поменяй базу распределения погрешности расчета себестоимости по данной аналитике

Реализацию писали дятлы. Если по закрытию месяца д. Б. Нули, а по факту имеем не нули - алгоритм кривой.