Есть сотрудник Иванова, которая когда-то(до 2010) года работала совместителем. Сейчас работает на должности у которой есть вредность, код позиции списка в должности указан.

При заполнении данных получаю таблицу периодов:
Период                Условия труда    
Начало    Окончание    Код особых условий труда    Код позиции списка
01.01.2012    22.01.2012        
23.01.2012    23.01.2012                
24.01.2012    31.03.2012                

В штатном расписании для этой должности и цеха код особых условий стоит.
Куда копать?

Проверь "Вид стажа для целей персонифицированного учета ПФР" в начислениях