Универсальный отчет с запросом и без, в чем разница? Как в универсальном отчете без запроса сгруппировать показатели?

Пользуйся чем умеешь, данные и так одни, результат не будет отличатся :)
Сгрупировать в универсальных можно только тогда, когда поле группировки включено в поля вывода самого отчета.