Кратко - так: в процедуре на сервере выбрать запросом все документы с не заполненным реквизитом, затем циклом обойти выборку из результата запроса, на каждой итерации которого получить объект документа, изменить значение реквизита на нужное и записать объект документа. Можно даже в транзакции сделать, но это уже тема другой статьи.