З/п считается в ЗУП, в Бухгалтерию попадает документом  Отражение зарплаты в бухучете. Там выплаты декретницам имеют вид операции "Расходы по страхованию ФСС".
А когда приходит возврат от ФСС, то в документе Поступление на расчетный счет такого вида нет ( поле Виды платежей в бюджент).Там совсем никакого нет подходящего по смыслу.
Как оформить?

нашла решение со сменой рабочей даты программы на 31.12.16. сделала, но это оч странно

Руками делать зачет Начислено/уплачено на Расходы по страхованию ФСС раз в квартал