Проблема решена. Удалил регистры накопления из расширения. Те которые дублируют основную конфигурацию. Их раньше надо было переносить в расширения для отчетов. Теперь работает без этого.
Для Бух 3.0.60.50 и ЗУП 3.1 та же ошибка.
Компьютеры — прекрасное средство для решения проблем, которых до их появления не было.