Опубликовать не проблема из конфигуратора. Вопрос, если другой человек публиковал и указал место публикации не стандартный каталог htdocs, а другой каталог. Как потом посмотреть какие публикации 1С и не только существуют у Apache и где они распологаются? Для IIS есть диспетчер IIS, соотвественно, как с это проверить в Apache?