ОбработкаКоманды(ПараметрКоманды, ПараметрыВыполненияКоманды)  и передать туда свои данные????

(0) Команду программно вызвать нельзя

Можно вызвать програмно команду формы.
В Вашем случае - переносить весь код команды в клиентский общий модуль.
И в команде вызывать уже его, но тогда Вам будут доступны эти алгоритмы из любого места конфигурации

(2) это понятно просто добавляются при некоторых вариантах кнопки и скрывается стандартная кнопка  , но команду хотел вызвать ту

проще бы было вызвать стандартную команду и добавить в параметр выполнение свой параметр.