Переношу часть функционала из расширения в основную конфигурацию, перенес форму из расширения сейчас хочу её временно отключить в расширении и попробовать запустить  на основной, подскажите как это можно сделать? "портить" и удалять расширение пока не хочется

ты - не ты, если не делаешь это на рабочей!

(1) в хранилище работаю

"частично" отключить расширение для некоторых объектов конфигурации нельзя
А так там есть галка отключить

В ряд ли можно частично отключить.

Так ведь для этого и придумали расширения. У тебя некая новая доработка. Не вполне отработанная идея. Оно пишется, запускается, выпускается на своем отдельном расширении, и тут - приняли эту доработку! переносим в основное. Ну там, в расширение основное или в конфигурацию - это уж как кому повезет.