если отдано бабло (немалое) за интегрированное решение, то зачем ломать интеграцию? За что тогда деньги? Как (и когда) перестанут нормально поддерживать - тогда и можно купить отдельную бухию.
Не надо выносить Бухгалтерию в отдельную базу
Компьютеры — прекрасное средство для решения проблем, которых до их появления не было.