Элемент не был помечен на удаление по причине:
Действие не может выполняться в режиме загрузки данных

Стандартная обработка в типовой БП 3.0 Поиск и удаление дублей

Как исправить?

отключить режим загрузки данных

(1) не включал )

писать расширение?
а почему в типовой так?

(3) Это скорей всего наведенная ошибка. Причем не БСПшной обработки, а прикладной логики БП.

Там, ЕМНИП пометка на удаление в самом конце происходит, когда дубли обработаны и все уже перевесилось на нужное. Исходные дубли помечаются на удаление, при этом срабатывает какая-то прикладная логика какого-то элемента, который что-то там пытается при пометке сделать и не может.

Надо в код БП.