Добрый день!

При проведении документа "Корректировка реализации" товар должен возвращаться на 41 счет, так как при реализации он был списан с этого счета. Но документ не возвращает товар на 41 счет.

В чем может быть проблема?

Какая конфигурация?
Какой Ваш статус в компании? Программный код читать умеете?
Программировать умеете?

"В чем может быть проблема?" - еще как вариант, проблема может быть в неправильном оформлении Корректировки.

(1) 1. Управление холдингом 3.2.3.32
2. Постоянка
3. С трудом

небось корректировка прошлого налогового периода?

(3) Не сдавайтесь!

Сурово здесь с новичками... прям дедовщина... не так сидишь, не так свистишь...

(0) Гляньте функционал своей конфигурации. Если он обычный, то надо как-то сказать программе, что произошёл физический возврат товара. Например, отдельным доком вроде "Акта о расхождениях".
Если же функционал крутой, то в самом доке Корректировки реализации должен быть выбор вида исправления, связанного с количеством товара, например "Возврат недопоставленного товара".

Настройки проводок еще можно посмотреть. Вообще отладчиком нужно.
УХ довольно дорогая конфа насколкьо я помню. Неужели нет штатных 1Сников?

(7) Конфигурацию автор не озвучил.